國際物流管理軟件由商品包裝、儲存、運輸、檢驗、流通加工及前后分揀、再包裝、國際配送等子系統組成。其中，儲運子系統是物流的兩大支柱。國際物流通過商品的儲運，實現自身的時空效益，滿足國際貿易活動和跨國公司運營的要求。

運輸子系統

國際貨物運輸是國際物流管理軟件的核心。國際貨物運輸具有路線長、環節多、涉及面廣、手續復雜、風險大、時間性強等特點。運輸成本在國際貿易商品價格中占很大比例。國際運輸主要包括運輸方式的選擇、運輸文件的處理和保險。

倉儲子系統

商品儲存。儲存使商品在流通過程中處于相對長或短的停滯狀態，這是完全必要的。因為，商品流通是一個從分散到集中，然后從集中到分散的穩定流通過程。國際貿易和跨國商品從制造商或供應部門運輸到運輸港口，有時需要臨時儲存一段時間，然后運輸出口，是一個集中和分散的過程。主要在各國的保稅區和保稅倉庫進行。主要涉及國家保稅制度和保稅倉庫建設。

保稅倉庫是經海關批準儲存保稅貨物的倉庫。必須有專門儲存和堆放貨物的安全設施；完善的倉庫管理制度和詳細的倉庫賬簿，配備經海關培訓認可的專職管理人員。保稅倉庫的出現為國際物流的海關倉儲提供了經濟便利的條件。

有時，買方（或賣方）將貨物暫時存放在保稅倉庫中一段時間。如果貨物最終重新出口，則無需繳納關稅或其他稅費；如果貨物出售，納稅時間可以推遲到實際出售。從物流的角度來看，應盡量減少存儲時間。存儲數量，加快貨物和資本周轉，實現國際物流的高效運行。