伴隨著企業經營模式的變化和計算機技術的發展，貨運軟件逐漸向管理一體化、網絡化、外向型、數據接口多樣化等方向發展。

一、一體化管理

貨物運輸軟件從最初的制單功能逐漸發展到單份單據的綜合管理和多份單據的輸出(打印、傳真、電子郵件、MSN、文件存取、批量輸出)、貨物狀態管理、收付費用管理、結算管理、發票管理、帳務管理等等。

從輸出最基本的數據統計報告到數據圖形報告、智能報告、輔助決策分析等；從業務管理發展到行政(OA)、客戶服務(EB)等功能。軟件集成功能日益豐富，模塊功能日益細化。它還提高了貨運軟件供應商進入市場的門檻。由成熟的貨運軟件廠商提供的貨運軟件，業務流程流暢，功能完善，人性化。

二、網絡化

隨著物流企業逐漸向集團化方向發展，對軟件提出了數據集中、數據分散管理的要求。這就需要數據集中在同一個服務器上進行存儲，要求各分公司能夠獨立管理數據，當然這樣對服務器和帶寬的要求也比較高。

另一個網絡化也體現在一些數據隨時可以在網上查詢到，這樣方便了公司管理人員或出差人員的管理。由于SaaS模式的出現和國內高昂的帶寬成本，SaaS模式的貨運軟件將成為中小企業的極佳選擇。

三、定向(信息交互)

物流軟件逐漸從過去的單打獨斗的企業內部業務向整個物流供應鏈各個環節之間的信息交互，構建行業社區環境。例如，與工廠外貿公司，外貿工廠，船舶公司，航空公司，保險，銀行，車隊，報關行，貨代同行，倉儲公司等的信息交互。

與此同時，貨運軟件供應商也在嘗試打破原有的軟件廠商間無法交互的情況，成立軟件聯盟，通過整合，建立統一的數據接口，以保證聯盟內軟件用戶能夠實現數據對接，從而產生了數據物流等新型服務。